A hős Yugi és barátai életük legnagyobb kihívásával találják szemben magukat, amikor megküzdenek Yugi ősi ellenségével, Kaibával. Anubisz, a gonosz egyiptomi istenség természetfeletti erővel ruházza fel Kaiba kártyáit, így a megidézett szupererős lények nem csupán Yugit fenyegetik, de az egész világot veszélybe sodorhatják.