Flash Gordon sikeres hosszútávfutó egy kisvárosban, Kahunában. Boldogan éldegél az anyjával, Norah-val, és van egy kis boltjuk a barátjával, Nick-kel. Flash édesapja fizikaprofesszor volt, de 13 évvel ezelőtt egy kísérlet során életét vesztette. A városba most visszatér Dale Arden, Flash régi szerelme, aki azonban már menyasszony. Dale a helyi tévé riportere, vőlegénye, Joe pedig rendőr. Eközben feltűnik Flash körül egy furcsa kis ember, aki állandóan követi. Amikor Flash elkapja és kifaggatja, kiderül, hogy Zarkov Flash apjának munkatársa volt, és furcsa módon úgy beszél Dr. Gordonról, mintha az még élne. Ez persze szöget üt Flash fejében. Ráadásul éppen ezzel egy időben fantasztikus hírek kezdenek szállingózni a városban egy földönkívüli érkezéséről és támadásairól. Flash azonnal rájön, hogy az események összefüggenek, így Zarkovval és Dale-lel együtt legyőzik a földönkívülit, majd az újból megnyílt dimenziókapun átlépve elindulnak, hogy megkeressék Flash Gordon apját.